Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP12P39900 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP12P39900 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP12P39900 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP12P39900 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP12P39900 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP12P39900 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP12P39900 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP12P39900 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP12P39900 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP12P39900 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP12P39900 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP12P39900 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP12P39900 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP12P39900 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP12P39900 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP12P39900 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP12P39900 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP12P39900 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP12P39900 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP12P39900 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP12P39900 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP12P39900 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP12P39900 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP12P39900 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP12P39900 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP12P39900 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP12P39900 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP12P39900 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP12P39900 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP12P39900 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MMP12P39900 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP12P39900 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP12P39900 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP12P39900 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP12P39900 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP12P39900 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP12P39900 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP12P39900 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP12P39900 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP12P39900 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP12P39900 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP12P39900 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP12P39900 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP12P39900 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP12P39900 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP12P39900 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP12P39900 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP12P39900 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP12P39900 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP12P39900 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP12P39900 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP12P39900 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP12P39900 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP12P39900 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP12P39900 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP12P39900 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP12P39900 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP12P39900 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP12P39900 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP12P39900 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP12P39900 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP12P39900 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP12P39900 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP12P39900 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP12P39900 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP12P39900 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP12P39900 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MMP12P39900 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MMP12P39900 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MMP12P39900 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP12P39900 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP12P39900 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP12P39900 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP12P39900 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP12P39900 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP12P39900 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP12P39900 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP12P39900 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP12P39900 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP12P39900 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP12P39900 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP12P39900 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP12P39900 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP12P39900 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP12P39900 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP12P39900 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP12P39900 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP12P39900 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP12P39900 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP12P39900 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP12P39900 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP12P39900 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP12P39900 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP12P39900 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MMP12P39900 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP12P39900 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP12P39900 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP12P39900 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP12P39900 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms