Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF4A3P38919 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF4A3P38919 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF4A3P38919 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms