Protein–RNA interactions for Protein: P38202

YBL028C, UPF0642 protein YBL028C, yeastyeast

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL028CP38202 YPL041CYPL041C 624 nt6.69□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 RPS9AYPL081W 594 nt6.69□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 CNE1YAL058W 1509 nt6.69□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 KKQ8YKL168C 2175 nt6.68□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 YKL031WYKL031W 414 nt6.68□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 LST8YNL006W 912 nt6.68□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 HIS7YBR248C 1659 nt6.68□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 RRP4YHR069C 1080 nt6.67□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 CRP1YHR146W 1398 nt6.67□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 YOR389WYOR389W 1875 nt6.66□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 YDR278CYDR278C 318 nt6.66□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 HSP12YFL014W 330 nt6.66□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.66□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.66□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.66□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 ARP2YDL029W 1176 nt6.65□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 YFL064CYFL064C 525 nt6.65□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 YPR202WYPR202W 717 nt6.65□□□□□ -1.34
YBL028CP38202 PPS1YBR276C 2424 nt6.65□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 EMW1YNL313C 2715 nt6.64□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 YCL065WYCL065W 369 nt6.64□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 SHO1YER118C 1104 nt6.64□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 MRPL36YBR122C 534 nt6.64□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 YDR154CYDR154C 351 nt6.63□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 YRA1YDR381W 681 nt6.63□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 MLC1YGL106W 450 nt6.63□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 VMA16YHR026W 642 nt6.62□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 LDB18YLL049W 540 nt6.62□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 YLR194CYLR194C 765 nt6.62□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 SEC13YLR208W 894 nt6.62□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 PNP1YLR209C 936 nt6.62□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 APE3YBR286W 1614 nt6.61□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 YBR284WYBR284W 2394 nt6.61□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 VPS61YDR136C 573 nt6.61□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 RPT3YDR394W 1287 nt6.61□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 CAR1YPL111W 1002 nt6.61□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 KTR3YBR205W 1215 nt6.61□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 LDB19YOR322C 2457 nt6.61□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 ARP3YJR065C 1350 nt6.6□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 YDL114WYDL114W 927 nt6.6□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 FRS2YFL022C 1512 nt6.6□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 RQC1YDR333C 2172 nt6.59□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 YDR109CYDR109C 2148 nt6.59□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 GLE1YDL207W 1617 nt6.59□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 BDF2YDL070W 1917 nt6.59□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 YEA6YEL006W 1008 nt6.59□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 DUS4YLR405W 1104 nt6.59□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 IDP3YNL009W 1263 nt6.59□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 ERI1YPL096C-A 207 nt6.59□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 YBR226CYBR226C 411 nt6.59□□□□□ -1.35
YBL028CP38202 SHM1YBR263W 1473 nt6.59□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 MCM3YEL032W 2916 nt6.59□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 TEA1YOR337W 2280 nt6.59□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 AMD1YML035C 2433 nt6.58□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 TEP1YNL128W 1305 nt6.58□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 ARG81YML099C 2643 nt6.58□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 IRS4YKR019C 1848 nt6.58□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 YDL057WYDL057W 987 nt6.58□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 QNS1YHR074W 2145 nt6.58□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 HXT2YMR011W 1626 nt6.58□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 VRP1YLR337C 2454 nt6.57□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 KNH1YDL049C 807 nt6.57□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 GIR2YDR152W 798 nt6.57□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 CIT3YPR001W 1461 nt6.57□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 CYC8YBR112C 2901 nt6.57□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 ORC5YNL261W 1440 nt6.57□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 MEU1YLR017W 1014 nt6.56□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 YMR155WYMR155W 1644 nt6.56□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 ADE13YLR359W 1449 nt6.56□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 GIT1YCR098C 1557 nt6.56□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 MSS1YMR023C 1581 nt6.56□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 VMA2YBR127C 1554 nt6.56□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 ECM38YLR299W 1983 nt6.55□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 DJP1YIR004W 1299 nt6.55□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 MRPL13YKR006C 795 nt6.55□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 PET112YBL080C 1626 nt6.54□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 ATG22YCL038C 1587 nt6.54□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 DAL82YNL314W 768 nt6.54□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 SKY1YMR216C 2229 nt6.54□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 HXK2YGL253W 1461 nt6.53□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 GAA1YLR088W 1845 nt6.53□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 ERG3YLR056W 1098 nt6.53□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 HSP26YBR072W 645 nt6.53□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 YCL041CYCL041C 495 nt6.53□□□□□ -1.36
YBL028CP38202 TRP5YGL026C 2124 nt6.52□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 YGR176WYGR176W 348 nt6.52□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 SMK1YPR054W 1167 nt6.52□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 NOG2YNR053C 1461 nt6.52□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 YAP1801YHR161C 1914 nt6.52□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 MRPL1YDR116C 858 nt6.51□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 APS3YJL024C 585 nt6.51□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 PRM10YJL108C 1152 nt6.51□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 YNR040WYNR040W 771 nt6.51□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 MOD5YOR274W 1287 nt6.51□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt6.51□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 ALT2YDR111C 1524 nt6.5□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 PRP46YPL151C 1356 nt6.5□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 LYS12YIL094C 1116 nt6.5□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 YLR118CYLR118C 684 nt6.5□□□□□ -1.37
YBL028CP38202 GUF1YLR289W 1938 nt6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.4 ms