Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SCNN1AP37088 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCNN1AP37088 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCNN1AP37088 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCNN1AP37088 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCNN1AP37088 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCNN1AP37088 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1146.5 ms