Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPL4P36578 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL4P36578 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPL4P36578 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL4P36578 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL4P36578 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL4P36578 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL4P36578 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL4P36578 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL4P36578 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL4P36578 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL4P36578 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL4P36578 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL4P36578 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL4P36578 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL4P36578 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPL4P36578 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL4P36578 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL4P36578 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL4P36578 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL4P36578 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL4P36578 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL4P36578 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPL4P36578 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL4P36578 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL4P36578 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL4P36578 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL4P36578 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL4P36578 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL4P36578 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RPL4P36578 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL4P36578 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL4P36578 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL4P36578 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL4P36578 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL4P36578 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL4P36578 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPL4P36578 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL4P36578 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL4P36578 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL4P36578 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL4P36578 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL4P36578 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPL4P36578 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL4P36578 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPL4P36578 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPL4P36578 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPL4P36578 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL4P36578 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL4P36578 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL4P36578 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL4P36578 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL4P36578 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL4P36578 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL4P36578 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPL4P36578 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL4P36578 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL4P36578 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL4P36578 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL4P36578 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPL4P36578 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL4P36578 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL4P36578 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL4P36578 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL4P36578 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL4P36578 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL4P36578 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL4P36578 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL4P36578 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL4P36578 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPL4P36578 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL4P36578 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL4P36578 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL4P36578 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL4P36578 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL4P36578 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL4P36578 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL4P36578 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPL4P36578 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL4P36578 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL4P36578 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL4P36578 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL4P36578 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL4P36578 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL4P36578 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPL4P36578 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL4P36578 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL4P36578 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL4P36578 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL4P36578 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL4P36578 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL4P36578 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL4P36578 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL4P36578 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL4P36578 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL4P36578 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL4P36578 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPL4P36578 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPL4P36578 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPL4P36578 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms