Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP5C1P36542 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP5C1P36542 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5C1P36542 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5C1P36542 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP5C1P36542 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms