Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM23P36406 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM23P36406 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM23P36406 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms