Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT20P35900 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT20P35900 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT20P35900 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT20P35900 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT20P35900 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT20P35900 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT20P35900 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT20P35900 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT20P35900 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT20P35900 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT20P35900 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT20P35900 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT20P35900 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT20P35900 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT20P35900 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT20P35900 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT20P35900 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT20P35900 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT20P35900 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT20P35900 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT20P35900 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT20P35900 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT20P35900 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT20P35900 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT20P35900 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT20P35900 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT20P35900 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT20P35900 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT20P35900 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT20P35900 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT20P35900 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT20P35900 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT20P35900 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT20P35900 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT20P35900 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT20P35900 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT20P35900 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT20P35900 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT20P35900 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT20P35900 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT20P35900 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT20P35900 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT20P35900 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT20P35900 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT20P35900 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT20P35900 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT20P35900 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT20P35900 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT20P35900 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT20P35900 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT20P35900 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT20P35900 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT20P35900 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT20P35900 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT20P35900 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT20P35900 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT20P35900 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT20P35900 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT20P35900 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT20P35900 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT20P35900 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT20P35900 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT20P35900 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT20P35900 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT20P35900 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT20P35900 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT20P35900 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT20P35900 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT20P35900 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT20P35900 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT20P35900 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT20P35900 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT20P35900 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT20P35900 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT20P35900 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT20P35900 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT20P35900 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms