Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DDIT3P35638 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDIT3P35638 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDIT3P35638 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms