Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
THBS4P35443 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
THBS4P35443 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
THBS4P35443 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
THBS4P35443 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
THBS4P35443 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
THBS4P35443 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
THBS4P35443 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
THBS4P35443 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
THBS4P35443 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
THBS4P35443 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
THBS4P35443 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
THBS4P35443 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
THBS4P35443 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
THBS4P35443 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
THBS4P35443 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
THBS4P35443 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
THBS4P35443 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
THBS4P35443 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
THBS4P35443 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
THBS4P35443 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
THBS4P35443 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
THBS4P35443 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
THBS4P35443 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
THBS4P35443 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
THBS4P35443 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
THBS4P35443 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
THBS4P35443 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
THBS4P35443 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
THBS4P35443 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
THBS4P35443 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
THBS4P35443 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
THBS4P35443 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
THBS4P35443 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
THBS4P35443 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
THBS4P35443 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
THBS4P35443 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
THBS4P35443 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
THBS4P35443 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
THBS4P35443 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
THBS4P35443 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
THBS4P35443 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
THBS4P35443 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
THBS4P35443 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
THBS4P35443 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
THBS4P35443 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
THBS4P35443 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
THBS4P35443 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
THBS4P35443 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
THBS4P35443 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
THBS4P35443 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
THBS4P35443 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
THBS4P35443 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
THBS4P35443 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
THBS4P35443 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
THBS4P35443 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
THBS4P35443 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
THBS4P35443 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
THBS4P35443 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
THBS4P35443 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
THBS4P35443 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
THBS4P35443 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
THBS4P35443 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
THBS4P35443 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
THBS4P35443 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
THBS4P35443 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
THBS4P35443 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
THBS4P35443 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
THBS4P35443 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
THBS4P35443 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
THBS4P35443 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
THBS4P35443 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
THBS4P35443 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
THBS4P35443 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
THBS4P35443 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
THBS4P35443 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
THBS4P35443 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
THBS4P35443 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
THBS4P35443 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
THBS4P35443 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
THBS4P35443 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
THBS4P35443 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
THBS4P35443 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
THBS4P35443 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
THBS4P35443 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
THBS4P35443 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
THBS4P35443 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
THBS4P35443 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
THBS4P35443 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
THBS4P35443 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
THBS4P35443 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
THBS4P35443 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
THBS4P35443 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
THBS4P35443 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
THBS4P35443 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
THBS4P35443 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
THBS4P35443 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
THBS4P35443 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
THBS4P35443 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
THBS4P35443 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms