Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM5P33992 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM5P33992 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM5P33992 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCM5P33992 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCM5P33992 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCM5P33992 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCM5P33992 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCM5P33992 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCM5P33992 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM5P33992 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM5P33992 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM5P33992 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM5P33992 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM5P33992 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM5P33992 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM5P33992 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM5P33992 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM5P33992 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM5P33992 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM5P33992 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM5P33992 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM5P33992 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM5P33992 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM5P33992 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM5P33992 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM5P33992 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM5P33992 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM5P33992 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM5P33992 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM5P33992 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM5P33992 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
MCM5P33992 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM5P33992 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM5P33992 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM5P33992 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM5P33992 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCM5P33992 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM5P33992 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM5P33992 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM5P33992 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM5P33992 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM5P33992 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM5P33992 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM5P33992 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM5P33992 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM5P33992 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM5P33992 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM5P33992 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM5P33992 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM5P33992 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM5P33992 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM5P33992 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM5P33992 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM5P33992 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM5P33992 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM5P33992 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM5P33992 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM5P33992 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM5P33992 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM5P33992 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM5P33992 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM5P33992 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM5P33992 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM5P33992 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM5P33992 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM5P33992 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM5P33992 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM5P33992 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM5P33992 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM5P33992 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM5P33992 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM5P33992 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM5P33992 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM5P33992 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM5P33992 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM5P33992 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM5P33992 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM5P33992 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM5P33992 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM5P33992 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM5P33992 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM5P33992 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM5P33992 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM5P33992 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCM5P33992 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MCM5P33992 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCM5P33992 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM5P33992 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM5P33992 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM5P33992 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM5P33992 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM5P33992 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM5P33992 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM5P33992 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM5P33992 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM5P33992 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCM5P33992 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM5P33992 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM5P33992 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms