Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTX2P32243 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTX2P32243 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OTX2P32243 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTX2P32243 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX2P32243 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX2P32243 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX2P32243 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX2P32243 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX2P32243 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX2P32243 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX2P32243 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX2P32243 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX2P32243 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX2P32243 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX2P32243 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTX2P32243 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTX2P32243 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTX2P32243 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTX2P32243 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTX2P32243 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTX2P32243 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTX2P32243 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTX2P32243 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTX2P32243 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTX2P32243 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTX2P32243 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTX2P32243 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTX2P32243 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OTX2P32243 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTX2P32243 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTX2P32243 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTX2P32243 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX2P32243 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX2P32243 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX2P32243 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX2P32243 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX2P32243 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX2P32243 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX2P32243 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX2P32243 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX2P32243 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX2P32243 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTX2P32243 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX2P32243 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX2P32243 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX2P32243 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX2P32243 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX2P32243 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX2P32243 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX2P32243 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTX2P32243 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTX2P32243 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTX2P32243 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTX2P32243 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
OTX2P32243 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTX2P32243 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTX2P32243 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTX2P32243 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTX2P32243 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTX2P32243 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTX2P32243 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTX2P32243 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTX2P32243 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX2P32243 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX2P32243 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX2P32243 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX2P32243 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX2P32243 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX2P32243 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX2P32243 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTX2P32243 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
OTX2P32243 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTX2P32243 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTX2P32243 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTX2P32243 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTX2P32243 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTX2P32243 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTX2P32243 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTX2P32243 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTX2P32243 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTX2P32243 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTX2P32243 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OTX2P32243 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTX2P32243 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTX2P32243 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTX2P32243 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTX2P32243 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTX2P32243 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTX2P32243 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTX2P32243 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTX2P32243 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTX2P32243 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTX2P32243 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTX2P32243 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTX2P32243 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTX2P32243 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTX2P32243 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTX2P32243 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTX2P32243 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms