Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX1P32242 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX1P32242 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX1P32242 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX1P32242 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OTX1P32242 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTX1P32242 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTX1P32242 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTX1P32242 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTX1P32242 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTX1P32242 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OTX1P32242 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
OTX1P32242 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
OTX1P32242 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTX1P32242 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
OTX1P32242 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OTX1P32242 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTX1P32242 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTX1P32242 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTX1P32242 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTX1P32242 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
OTX1P32242 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTX1P32242 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTX1P32242 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OTX1P32242 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTX1P32242 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTX1P32242 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTX1P32242 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTX1P32242 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTX1P32242 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTX1P32242 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
OTX1P32242 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
OTX1P32242 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTX1P32242 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTX1P32242 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTX1P32242 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTX1P32242 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTX1P32242 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTX1P32242 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTX1P32242 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTX1P32242 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTX1P32242 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OTX1P32242 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTX1P32242 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTX1P32242 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTX1P32242 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTX1P32242 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTX1P32242 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTX1P32242 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
OTX1P32242 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
OTX1P32242 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTX1P32242 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTX1P32242 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTX1P32242 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTX1P32242 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTX1P32242 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTX1P32242 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OTX1P32242 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
OTX1P32242 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTX1P32242 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTX1P32242 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTX1P32242 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTX1P32242 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTX1P32242 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTX1P32242 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTX1P32242 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTX1P32242 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTX1P32242 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OTX1P32242 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTX1P32242 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTX1P32242 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTX1P32242 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
OTX1P32242 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTX1P32242 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTX1P32242 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OTX1P32242 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OTX1P32242 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OTX1P32242 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OTX1P32242 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OTX1P32242 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OTX1P32242 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OTX1P32242 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OTX1P32242 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
OTX1P32242 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
OTX1P32242 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
OTX1P32242 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
OTX1P32242 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
OTX1P32242 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
OTX1P32242 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
OTX1P32242 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
OTX1P32242 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OTX1P32242 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OTX1P32242 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OTX1P32242 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OTX1P32242 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OTX1P32242 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OTX1P32242 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OTX1P32242 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OTX1P32242 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OTX1P32242 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms