Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MARCKSP29966 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MARCKSP29966 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARCKSP29966 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms