Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID4AP29374 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID4AP29374 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID4AP29374 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID4AP29374 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ARID4AP29374 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARID4AP29374 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARID4AP29374 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARID4AP29374 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms