Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EPHB2P29323 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EPHB2P29323 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms