Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMA1P25391 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LAMA1P25391 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms