Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
EPHA1P21709 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EPHA1P21709 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EPHA1P21709 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms