Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACO1P21399 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACO1P21399 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACO1P21399 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACO1P21399 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACO1P21399 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACO1P21399 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACO1P21399 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACO1P21399 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACO1P21399 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ACO1P21399 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACO1P21399 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ACO1P21399 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACO1P21399 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ACO1P21399 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACO1P21399 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACO1P21399 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACO1P21399 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACO1P21399 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACO1P21399 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACO1P21399 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACO1P21399 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACO1P21399 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACO1P21399 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACO1P21399 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACO1P21399 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ACO1P21399 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACO1P21399 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACO1P21399 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACO1P21399 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ACO1P21399 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACO1P21399 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACO1P21399 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACO1P21399 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACO1P21399 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACO1P21399 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACO1P21399 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACO1P21399 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACO1P21399 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACO1P21399 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACO1P21399 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACO1P21399 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ACO1P21399 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ACO1P21399 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACO1P21399 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACO1P21399 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACO1P21399 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACO1P21399 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACO1P21399 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACO1P21399 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACO1P21399 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACO1P21399 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACO1P21399 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACO1P21399 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACO1P21399 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ACO1P21399 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ACO1P21399 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACO1P21399 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ACO1P21399 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACO1P21399 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACO1P21399 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACO1P21399 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACO1P21399 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACO1P21399 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACO1P21399 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACO1P21399 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACO1P21399 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ACO1P21399 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACO1P21399 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACO1P21399 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACO1P21399 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACO1P21399 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACO1P21399 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACO1P21399 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACO1P21399 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACO1P21399 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACO1P21399 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACO1P21399 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACO1P21399 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACO1P21399 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACO1P21399 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACO1P21399 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACO1P21399 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACO1P21399 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACO1P21399 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACO1P21399 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACO1P21399 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ACO1P21399 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACO1P21399 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACO1P21399 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACO1P21399 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACO1P21399 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACO1P21399 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACO1P21399 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACO1P21399 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACO1P21399 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACO1P21399 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACO1P21399 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACO1P21399 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACO1P21399 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms