Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASTP20810 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CASTP20810 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASTP20810 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASTP20810 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASTP20810 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASTP20810 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASTP20810 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASTP20810 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASTP20810 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASTP20810 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CASTP20810 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASTP20810 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASTP20810 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CASTP20810 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASTP20810 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASTP20810 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CASTP20810 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASTP20810 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASTP20810 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASTP20810 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASTP20810 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASTP20810 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASTP20810 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASTP20810 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CASTP20810 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASTP20810 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASTP20810 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASTP20810 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CASTP20810 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASTP20810 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASTP20810 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASTP20810 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASTP20810 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASTP20810 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASTP20810 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASTP20810 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASTP20810 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CASTP20810 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CASTP20810 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CASTP20810 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASTP20810 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASTP20810 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASTP20810 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CASTP20810 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASTP20810 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASTP20810 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASTP20810 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASTP20810 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASTP20810 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASTP20810 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASTP20810 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASTP20810 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASTP20810 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASTP20810 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CASTP20810 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASTP20810 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASTP20810 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASTP20810 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASTP20810 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASTP20810 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASTP20810 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASTP20810 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASTP20810 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASTP20810 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASTP20810 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASTP20810 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASTP20810 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASTP20810 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASTP20810 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASTP20810 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASTP20810 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASTP20810 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASTP20810 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASTP20810 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASTP20810 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASTP20810 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASTP20810 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASTP20810 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASTP20810 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASTP20810 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASTP20810 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CASTP20810 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASTP20810 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASTP20810 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CASTP20810 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASTP20810 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASTP20810 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASTP20810 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASTP20810 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASTP20810 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASTP20810 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASTP20810 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASTP20810 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASTP20810 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASTP20810 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASTP20810 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASTP20810 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASTP20810 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASTP20810 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms