Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NR1D1P20393 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1D1P20393 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1D1P20393 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR1D1P20393 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms