Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB5AP20339 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB5AP20339 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB5AP20339 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms