Protein–RNA interactions for Protein: P20062

TCN2, Transcobalamin-2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN2P20062 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCN2P20062 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN2P20062 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN2P20062 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN2P20062 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN2P20062 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN2P20062 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN2P20062 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCN2P20062 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCN2P20062 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCN2P20062 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCN2P20062 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TCN2P20062 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCN2P20062 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCN2P20062 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCN2P20062 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCN2P20062 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCN2P20062 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCN2P20062 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN2P20062 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN2P20062 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN2P20062 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN2P20062 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN2P20062 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCN2P20062 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN2P20062 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN2P20062 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN2P20062 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN2P20062 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCN2P20062 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TCN2P20062 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TCN2P20062 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCN2P20062 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCN2P20062 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCN2P20062 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCN2P20062 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCN2P20062 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCN2P20062 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCN2P20062 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN2P20062 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN2P20062 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN2P20062 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN2P20062 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN2P20062 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN2P20062 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCN2P20062 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN2P20062 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN2P20062 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN2P20062 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN2P20062 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN2P20062 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN2P20062 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCN2P20062 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN2P20062 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN2P20062 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN2P20062 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN2P20062 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN2P20062 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN2P20062 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN2P20062 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCN2P20062 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN2P20062 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN2P20062 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN2P20062 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN2P20062 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN2P20062 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN2P20062 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN2P20062 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN2P20062 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCN2P20062 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN2P20062 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN2P20062 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN2P20062 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN2P20062 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN2P20062 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN2P20062 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN2P20062 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN2P20062 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN2P20062 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN2P20062 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCN2P20062 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN2P20062 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN2P20062 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN2P20062 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN2P20062 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCN2P20062 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCN2P20062 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCN2P20062 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCN2P20062 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCN2P20062 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCN2P20062 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCN2P20062 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN2P20062 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN2P20062 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN2P20062 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN2P20062 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN2P20062 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN2P20062 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN2P20062 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCN2P20062 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms