Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCAP17252 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCAP17252 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms