Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF43P17038 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF43P17038 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF43P17038 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF43P17038 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF43P17038 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF43P17038 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF43P17038 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF43P17038 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF43P17038 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF43P17038 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF43P17038 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF43P17038 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF43P17038 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF43P17038 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF43P17038 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF43P17038 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF43P17038 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF43P17038 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF43P17038 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF43P17038 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF43P17038 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF43P17038 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF43P17038 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF43P17038 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF43P17038 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF43P17038 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF43P17038 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF43P17038 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF43P17038 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF43P17038 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF43P17038 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF43P17038 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF43P17038 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF43P17038 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF43P17038 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF43P17038 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF43P17038 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF43P17038 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF43P17038 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF43P17038 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF43P17038 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF43P17038 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF43P17038 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF43P17038 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF43P17038 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms