Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GNB3P16520 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB3P16520 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB3P16520 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB3P16520 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB3P16520 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB3P16520 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB3P16520 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB3P16520 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GNB3P16520 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB3P16520 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB3P16520 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB3P16520 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB3P16520 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB3P16520 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB3P16520 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB3P16520 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB3P16520 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB3P16520 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB3P16520 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB3P16520 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB3P16520 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GNB3P16520 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GNB3P16520 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GNB3P16520 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNB3P16520 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNB3P16520 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNB3P16520 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNB3P16520 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNB3P16520 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNB3P16520 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GNB3P16520 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GNB3P16520 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GNB3P16520 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNB3P16520 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNB3P16520 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GNB3P16520 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB3P16520 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB3P16520 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB3P16520 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB3P16520 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB3P16520 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB3P16520 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB3P16520 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB3P16520 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB3P16520 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB3P16520 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GNB3P16520 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNB3P16520 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNB3P16520 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNB3P16520 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GNB3P16520 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GNB3P16520 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GNB3P16520 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GNB3P16520 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB3P16520 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB3P16520 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB3P16520 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB3P16520 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB3P16520 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB3P16520 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB3P16520 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB3P16520 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB3P16520 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB3P16520 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GNB3P16520 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GNB3P16520 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms