Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTLA4P16410 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CTLA4P16410 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTLA4P16410 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms