Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NID1P14543 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NID1P14543 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NID1P14543 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NID1P14543 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NID1P14543 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NID1P14543 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NID1P14543 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NID1P14543 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NID1P14543 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NID1P14543 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NID1P14543 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NID1P14543 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NID1P14543 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NID1P14543 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NID1P14543 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NID1P14543 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NID1P14543 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NID1P14543 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NID1P14543 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NID1P14543 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NID1P14543 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NID1P14543 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NID1P14543 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NID1P14543 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NID1P14543 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NID1P14543 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NID1P14543 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NID1P14543 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NID1P14543 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NID1P14543 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NID1P14543 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NID1P14543 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NID1P14543 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NID1P14543 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NID1P14543 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NID1P14543 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NID1P14543 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NID1P14543 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NID1P14543 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NID1P14543 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NID1P14543 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NID1P14543 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NID1P14543 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NID1P14543 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NID1P14543 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NID1P14543 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NID1P14543 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NID1P14543 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NID1P14543 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NID1P14543 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NID1P14543 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NID1P14543 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NID1P14543 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NID1P14543 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NID1P14543 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NID1P14543 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NID1P14543 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NID1P14543 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NID1P14543 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NID1P14543 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NID1P14543 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NID1P14543 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NID1P14543 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NID1P14543 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NID1P14543 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NID1P14543 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NID1P14543 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NID1P14543 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NID1P14543 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NID1P14543 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NID1P14543 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NID1P14543 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NID1P14543 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NID1P14543 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NID1P14543 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NID1P14543 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NID1P14543 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NID1P14543 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NID1P14543 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NID1P14543 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NID1P14543 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NID1P14543 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NID1P14543 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NID1P14543 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NID1P14543 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NID1P14543 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NID1P14543 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NID1P14543 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NID1P14543 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NID1P14543 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NID1P14543 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NID1P14543 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NID1P14543 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NID1P14543 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NID1P14543 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NID1P14543 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NID1P14543 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NID1P14543 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NID1P14543 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms