Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEPDP12955 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEPDP12955 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEPDP12955 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEPDP12955 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEPDP12955 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEPDP12955 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEPDP12955 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEPDP12955 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEPDP12955 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEPDP12955 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEPDP12955 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PEPDP12955 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEPDP12955 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEPDP12955 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEPDP12955 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEPDP12955 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEPDP12955 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEPDP12955 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEPDP12955 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PEPDP12955 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PEPDP12955 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PEPDP12955 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEPDP12955 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEPDP12955 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEPDP12955 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PEPDP12955 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEPDP12955 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEPDP12955 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PEPDP12955 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEPDP12955 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEPDP12955 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEPDP12955 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEPDP12955 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PEPDP12955 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PEPDP12955 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEPDP12955 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEPDP12955 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEPDP12955 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEPDP12955 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEPDP12955 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEPDP12955 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEPDP12955 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PEPDP12955 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEPDP12955 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEPDP12955 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEPDP12955 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEPDP12955 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEPDP12955 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEPDP12955 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PEPDP12955 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEPDP12955 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEPDP12955 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PEPDP12955 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEPDP12955 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEPDP12955 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEPDP12955 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEPDP12955 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEPDP12955 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEPDP12955 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PEPDP12955 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PEPDP12955 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEPDP12955 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEPDP12955 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PEPDP12955 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PEPDP12955 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEPDP12955 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEPDP12955 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PEPDP12955 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PEPDP12955 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PEPDP12955 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEPDP12955 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEPDP12955 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEPDP12955 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEPDP12955 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEPDP12955 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEPDP12955 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PEPDP12955 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEPDP12955 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEPDP12955 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEPDP12955 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEPDP12955 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PEPDP12955 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEPDP12955 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEPDP12955 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PEPDP12955 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PEPDP12955 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEPDP12955 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEPDP12955 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEPDP12955 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEPDP12955 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEPDP12955 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEPDP12955 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEPDP12955 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PEPDP12955 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEPDP12955 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEPDP12955 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEPDP12955 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEPDP12955 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PEPDP12955 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1395.4 ms