Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYH1P12882 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYH1P12882 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYH1P12882 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH1P12882 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH1P12882 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH1P12882 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH1P12882 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH1P12882 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYH1P12882 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH1P12882 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH1P12882 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH1P12882 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYH1P12882 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYH1P12882 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYH1P12882 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYH1P12882 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYH1P12882 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYH1P12882 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYH1P12882 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH1P12882 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH1P12882 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH1P12882 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH1P12882 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYH1P12882 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH1P12882 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH1P12882 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH1P12882 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH1P12882 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH1P12882 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYH1P12882 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH1P12882 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH1P12882 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH1P12882 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYH1P12882 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH1P12882 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH1P12882 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH1P12882 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYH1P12882 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH1P12882 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH1P12882 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYH1P12882 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYH1P12882 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYH1P12882 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYH1P12882 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MYH1P12882 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MYH1P12882 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH1P12882 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH1P12882 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH1P12882 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH1P12882 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH1P12882 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH1P12882 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH1P12882 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH1P12882 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH1P12882 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH1P12882 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH1P12882 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH1P12882 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH1P12882 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH1P12882 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH1P12882 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH1P12882 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH1P12882 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH1P12882 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH1P12882 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH1P12882 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH1P12882 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH1P12882 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH1P12882 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH1P12882 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH1P12882 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH1P12882 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH1P12882 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH1P12882 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH1P12882 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH1P12882 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH1P12882 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH1P12882 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH1P12882 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH1P12882 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH1P12882 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH1P12882 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH1P12882 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH1P12882 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH1P12882 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH1P12882 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH1P12882 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH1P12882 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH1P12882 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH1P12882 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYH1P12882 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH1P12882 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH1P12882 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH1P12882 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH1P12882 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH1P12882 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH1P12882 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH1P12882 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH1P12882 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms