Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP1P11387 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP1P11387 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP1P11387 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP1P11387 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP1P11387 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP1P11387 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP1P11387 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP1P11387 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOP1P11387 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP1P11387 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP1P11387 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP1P11387 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP1P11387 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP1P11387 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP1P11387 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP1P11387 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP1P11387 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TOP1P11387 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP1P11387 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP1P11387 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP1P11387 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP1P11387 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP1P11387 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TOP1P11387 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP1P11387 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP1P11387 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TOP1P11387 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP1P11387 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP1P11387 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP1P11387 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP1P11387 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP1P11387 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP1P11387 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TOP1P11387 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP1P11387 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP1P11387 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP1P11387 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP1P11387 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TOP1P11387 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
TOP1P11387 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP1P11387 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP1P11387 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP1P11387 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP1P11387 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TOP1P11387 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP1P11387 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TOP1P11387 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP1P11387 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TOP1P11387 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TOP1P11387 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TOP1P11387 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TOP1P11387 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP1P11387 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP1P11387 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP1P11387 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP1P11387 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP1P11387 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP1P11387 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP1P11387 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP1P11387 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP1P11387 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TOP1P11387 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP1P11387 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP1P11387 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP1P11387 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP1P11387 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP1P11387 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP1P11387 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TOP1P11387 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP1P11387 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP1P11387 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP1P11387 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP1P11387 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP1P11387 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TOP1P11387 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP1P11387 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP1P11387 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP1P11387 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TOP1P11387 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TOP1P11387 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP1P11387 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP1P11387 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TOP1P11387 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP1P11387 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP1P11387 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP1P11387 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP1P11387 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP1P11387 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP1P11387 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP1P11387 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TOP1P11387 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP1P11387 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP1P11387 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP1P11387 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP1P11387 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP1P11387 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP1P11387 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TOP1P11387 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TOP1P11387 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms