Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARAP10276 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARAP10276 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARAP10276 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARAP10276 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARAP10276 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARAP10276 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARAP10276 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARAP10276 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARAP10276 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARAP10276 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARAP10276 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARAP10276 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARAP10276 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RARAP10276 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RARAP10276 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARAP10276 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARAP10276 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARAP10276 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARAP10276 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARAP10276 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARAP10276 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARAP10276 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARAP10276 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARAP10276 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARAP10276 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARAP10276 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARAP10276 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARAP10276 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARAP10276 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RARAP10276 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARAP10276 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARAP10276 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARAP10276 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARAP10276 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RARAP10276 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARAP10276 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARAP10276 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARAP10276 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARAP10276 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RARAP10276 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RARAP10276 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARAP10276 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARAP10276 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RARAP10276 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RARAP10276 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARAP10276 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARAP10276 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARAP10276 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARAP10276 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARAP10276 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARAP10276 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARAP10276 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARAP10276 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARAP10276 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARAP10276 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARAP10276 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RARAP10276 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARAP10276 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARAP10276 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARAP10276 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARAP10276 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARAP10276 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARAP10276 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARAP10276 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARAP10276 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARAP10276 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARAP10276 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARAP10276 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARAP10276 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARAP10276 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARAP10276 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RARAP10276 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARAP10276 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARAP10276 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARAP10276 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARAP10276 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARAP10276 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RARAP10276 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARAP10276 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARAP10276 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARAP10276 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARAP10276 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARAP10276 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARAP10276 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARAP10276 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARAP10276 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARAP10276 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARAP10276 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARAP10276 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARAP10276 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARAP10276 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RARAP10276 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RARAP10276 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARAP10276 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARAP10276 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARAP10276 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARAP10276 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARAP10276 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARAP10276 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms