Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBBP0CG47 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBBP0CG47 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms