Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2MP0CAP2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2MP0CAP2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2MP0CAP2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms