Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC175P0C221 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC175P0C221 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC175P0C221 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms