Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP1P09874 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP1P09874 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP1P09874 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP1P09874 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP1P09874 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP1P09874 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP1P09874 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP1P09874 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP1P09874 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP1P09874 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP1P09874 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP1P09874 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP1P09874 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP1P09874 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP1P09874 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP1P09874 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP1P09874 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP1P09874 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP1P09874 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP1P09874 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP1P09874 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP1P09874 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP1P09874 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP1P09874 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP1P09874 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP1P09874 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP1P09874 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP1P09874 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP1P09874 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP1P09874 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP1P09874 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP1P09874 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP1P09874 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP1P09874 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP1P09874 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP1P09874 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP1P09874 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP1P09874 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP1P09874 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP1P09874 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP1P09874 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP1P09874 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP1P09874 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP1P09874 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP1P09874 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP1P09874 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP1P09874 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP1P09874 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP1P09874 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP1P09874 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP1P09874 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP1P09874 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PARP1P09874 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP1P09874 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP1P09874 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP1P09874 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP1P09874 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP1P09874 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PARP1P09874 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP1P09874 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP1P09874 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP1P09874 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP1P09874 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PARP1P09874 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP1P09874 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP1P09874 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP1P09874 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP1P09874 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP1P09874 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP1P09874 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP1P09874 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PARP1P09874 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP1P09874 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP1P09874 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP1P09874 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP1P09874 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARP1P09874 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP1P09874 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP1P09874 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP1P09874 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP1P09874 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARP1P09874 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP1P09874 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP1P09874 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP1P09874 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP1P09874 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP1P09874 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP1P09874 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP1P09874 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP1P09874 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP1P09874 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP1P09874 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP1P09874 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP1P09874 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP1P09874 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP1P09874 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARP1P09874 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP1P09874 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARP1P09874 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms