Protein–RNA interactions for Protein: P09669

COX6C, Cytochrome c oxidase subunit 6C, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6CP09669 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6CP09669 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6CP09669 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6CP09669 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6CP09669 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6CP09669 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX6CP09669 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6CP09669 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6CP09669 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6CP09669 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6CP09669 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6CP09669 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COX6CP09669 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6CP09669 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6CP09669 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6CP09669 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6CP09669 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6CP09669 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6CP09669 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6CP09669 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6CP09669 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6CP09669 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX6CP09669 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX6CP09669 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX6CP09669 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX6CP09669 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX6CP09669 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX6CP09669 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX6CP09669 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX6CP09669 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX6CP09669 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6CP09669 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6CP09669 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6CP09669 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6CP09669 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6CP09669 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6CP09669 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6CP09669 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6CP09669 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6CP09669 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6CP09669 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX6CP09669 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6CP09669 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6CP09669 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6CP09669 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6CP09669 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6CP09669 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX6CP09669 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6CP09669 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6CP09669 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COX6CP09669 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6CP09669 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6CP09669 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6CP09669 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6CP09669 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6CP09669 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COX6CP09669 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6CP09669 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6CP09669 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6CP09669 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6CP09669 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COX6CP09669 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COX6CP09669 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6CP09669 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6CP09669 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6CP09669 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6CP09669 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6CP09669 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6CP09669 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6CP09669 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6CP09669 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6CP09669 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6CP09669 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6CP09669 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6CP09669 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6CP09669 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6CP09669 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6CP09669 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6CP09669 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6CP09669 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6CP09669 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6CP09669 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6CP09669 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6CP09669 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6CP09669 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6CP09669 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6CP09669 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms