Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT19P08727 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT19P08727 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT19P08727 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT19P08727 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT19P08727 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT19P08727 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT19P08727 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT19P08727 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT19P08727 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT19P08727 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT19P08727 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT19P08727 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT19P08727 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT19P08727 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT19P08727 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT19P08727 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT19P08727 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT19P08727 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT19P08727 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT19P08727 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT19P08727 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT19P08727 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT19P08727 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT19P08727 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT19P08727 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT19P08727 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT19P08727 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT19P08727 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT19P08727 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT19P08727 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT19P08727 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT19P08727 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT19P08727 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT19P08727 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT19P08727 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT19P08727 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT19P08727 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT19P08727 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT19P08727 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT19P08727 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT19P08727 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
KRT19P08727 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT19P08727 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT19P08727 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT19P08727 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT19P08727 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT19P08727 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT19P08727 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT19P08727 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT19P08727 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT19P08727 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT19P08727 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT19P08727 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT19P08727 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT19P08727 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT19P08727 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT19P08727 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT19P08727 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT19P08727 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT19P08727 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT19P08727 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT19P08727 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT19P08727 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT19P08727 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT19P08727 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT19P08727 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT19P08727 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT19P08727 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT19P08727 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT19P08727 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT19P08727 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT19P08727 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT19P08727 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT19P08727 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT19P08727 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT19P08727 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT19P08727 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT19P08727 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT19P08727 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT19P08727 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT19P08727 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT19P08727 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT19P08727 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT19P08727 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT19P08727 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT19P08727 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT19P08727 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT19P08727 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT19P08727 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT19P08727 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT19P08727 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT19P08727 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT19P08727 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT19P08727 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT19P08727 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT19P08727 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT19P08727 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT19P08727 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT19P08727 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms