Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GLI1P08151 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GLI1P08151 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GLI1P08151 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI1P08151 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI1P08151 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI1P08151 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI1P08151 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI1P08151 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI1P08151 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI1P08151 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI1P08151 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GLI1P08151 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GLI1P08151 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GLI1P08151 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GLI1P08151 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GLI1P08151 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GLI1P08151 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI1P08151 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI1P08151 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI1P08151 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI1P08151 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GLI1P08151 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI1P08151 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI1P08151 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI1P08151 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI1P08151 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI1P08151 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI1P08151 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI1P08151 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GLI1P08151 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI1P08151 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI1P08151 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI1P08151 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GLI1P08151 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI1P08151 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GLI1P08151 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI1P08151 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI1P08151 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI1P08151 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI1P08151 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI1P08151 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI1P08151 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI1P08151 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI1P08151 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GLI1P08151 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI1P08151 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI1P08151 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI1P08151 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI1P08151 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GLI1P08151 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI1P08151 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI1P08151 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI1P08151 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI1P08151 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI1P08151 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GLI1P08151 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI1P08151 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI1P08151 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI1P08151 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GLI1P08151 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI1P08151 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI1P08151 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI1P08151 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI1P08151 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GLI1P08151 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI1P08151 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI1P08151 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI1P08151 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI1P08151 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI1P08151 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI1P08151 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI1P08151 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI1P08151 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GLI1P08151 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GLI1P08151 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI1P08151 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI1P08151 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI1P08151 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI1P08151 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI1P08151 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI1P08151 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI1P08151 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI1P08151 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI1P08151 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GLI1P08151 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms