Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLK3P07288 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLK3P07288 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLK3P07288 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLK3P07288 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLK3P07288 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLK3P07288 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLK3P07288 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLK3P07288 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLK3P07288 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLK3P07288 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLK3P07288 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLK3P07288 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLK3P07288 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLK3P07288 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLK3P07288 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLK3P07288 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLK3P07288 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLK3P07288 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLK3P07288 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLK3P07288 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLK3P07288 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLK3P07288 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLK3P07288 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLK3P07288 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLK3P07288 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLK3P07288 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLK3P07288 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLK3P07288 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLK3P07288 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLK3P07288 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLK3P07288 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLK3P07288 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLK3P07288 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KLK3P07288 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLK3P07288 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLK3P07288 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLK3P07288 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLK3P07288 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLK3P07288 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLK3P07288 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLK3P07288 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KLK3P07288 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLK3P07288 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLK3P07288 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLK3P07288 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLK3P07288 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KLK3P07288 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLK3P07288 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLK3P07288 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLK3P07288 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLK3P07288 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLK3P07288 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLK3P07288 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLK3P07288 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLK3P07288 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLK3P07288 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLK3P07288 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLK3P07288 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLK3P07288 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLK3P07288 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLK3P07288 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLK3P07288 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLK3P07288 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLK3P07288 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLK3P07288 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLK3P07288 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLK3P07288 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLK3P07288 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLK3P07288 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLK3P07288 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLK3P07288 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLK3P07288 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLK3P07288 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLK3P07288 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLK3P07288 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLK3P07288 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLK3P07288 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLK3P07288 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLK3P07288 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLK3P07288 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLK3P07288 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLK3P07288 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLK3P07288 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLK3P07288 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLK3P07288 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLK3P07288 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLK3P07288 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLK3P07288 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLK3P07288 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLK3P07288 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLK3P07288 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLK3P07288 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLK3P07288 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLK3P07288 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLK3P07288 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLK3P07288 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLK3P07288 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLK3P07288 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLK3P07288 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms