Protein–RNA interactions for Protein: P06731

CEACAM5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM5P06731 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CEACAM5P06731 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CEACAM5P06731 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms