Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBB4AP04350 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TUBB4AP04350 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBB4AP04350 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms