Protein–RNA interactions for Protein: P03891

MT-ND2, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND2P03891 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MT-ND2P03891 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND2P03891 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND2P03891 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms