Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CST1P01037 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CST1P01037 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CST1P01037 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CST1P01037 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CST1P01037 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CST1P01037 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CST1P01037 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CST1P01037 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CST1P01037 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CST1P01037 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CST1P01037 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CST1P01037 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CST1P01037 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CST1P01037 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CST1P01037 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CST1P01037 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CST1P01037 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CST1P01037 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CST1P01037 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CST1P01037 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CST1P01037 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CST1P01037 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CST1P01037 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CST1P01037 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CST1P01037 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CST1P01037 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CST1P01037 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CST1P01037 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CST1P01037 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CST1P01037 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CST1P01037 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CST1P01037 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CST1P01037 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CST1P01037 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CST1P01037 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CST1P01037 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CST1P01037 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CST1P01037 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CST1P01037 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CST1P01037 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CST1P01037 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CST1P01037 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CST1P01037 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CST1P01037 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CST1P01037 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CST1P01037 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CST1P01037 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CST1P01037 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CST1P01037 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CST1P01037 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CST1P01037 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CST1P01037 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CST1P01037 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CST1P01037 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CST1P01037 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CST1P01037 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CST1P01037 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CST1P01037 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CST1P01037 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CST1P01037 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CST1P01037 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CST1P01037 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CST1P01037 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CST1P01037 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CST1P01037 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CST1P01037 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CST1P01037 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CST1P01037 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CST1P01037 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CST1P01037 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CST1P01037 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CST1P01037 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CST1P01037 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CST1P01037 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CST1P01037 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CST1P01037 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CST1P01037 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CST1P01037 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CST1P01037 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CST1P01037 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CST1P01037 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CST1P01037 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CST1P01037 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CST1P01037 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CST1P01037 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CST1P01037 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CST1P01037 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CST1P01037 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CST1P01037 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CST1P01037 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CST1P01037 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CST1P01037 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CST1P01037 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CST1P01037 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CST1P01037 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CST1P01037 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CST1P01037 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CST1P01037 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CST1P01037 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms