Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP4O95707 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP4O95707 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP4O95707 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POP4O95707 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP4O95707 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP4O95707 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP4O95707 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP4O95707 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP4O95707 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP4O95707 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP4O95707 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP4O95707 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP4O95707 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP4O95707 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP4O95707 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POP4O95707 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP4O95707 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP4O95707 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP4O95707 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP4O95707 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP4O95707 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP4O95707 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP4O95707 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POP4O95707 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POP4O95707 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POP4O95707 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POP4O95707 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POP4O95707 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POP4O95707 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POP4O95707 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP4O95707 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POP4O95707 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POP4O95707 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP4O95707 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP4O95707 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP4O95707 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP4O95707 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POP4O95707 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POP4O95707 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP4O95707 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP4O95707 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP4O95707 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP4O95707 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POP4O95707 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POP4O95707 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP4O95707 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP4O95707 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP4O95707 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP4O95707 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP4O95707 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP4O95707 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP4O95707 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP4O95707 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POP4O95707 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POP4O95707 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POP4O95707 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POP4O95707 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POP4O95707 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
POP4O95707 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POP4O95707 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POP4O95707 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POP4O95707 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POP4O95707 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP4O95707 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP4O95707 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP4O95707 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP4O95707 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP4O95707 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP4O95707 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP4O95707 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POP4O95707 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POP4O95707 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POP4O95707 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POP4O95707 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POP4O95707 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POP4O95707 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP4O95707 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP4O95707 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP4O95707 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP4O95707 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP4O95707 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP4O95707 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP4O95707 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP4O95707 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP4O95707 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP4O95707 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP4O95707 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP4O95707 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POP4O95707 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP4O95707 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POP4O95707 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP4O95707 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP4O95707 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP4O95707 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP4O95707 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP4O95707 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP4O95707 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP4O95707 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP4O95707 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms