Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGDSO95455 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGDSO95455 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGDSO95455 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGDSO95455 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGDSO95455 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGDSO95455 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGDSO95455 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGDSO95455 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TGDSO95455 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TGDSO95455 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGDSO95455 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGDSO95455 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGDSO95455 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGDSO95455 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGDSO95455 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGDSO95455 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGDSO95455 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TGDSO95455 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGDSO95455 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGDSO95455 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGDSO95455 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGDSO95455 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGDSO95455 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGDSO95455 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGDSO95455 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGDSO95455 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGDSO95455 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGDSO95455 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGDSO95455 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGDSO95455 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TGDSO95455 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGDSO95455 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGDSO95455 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGDSO95455 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGDSO95455 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGDSO95455 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGDSO95455 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGDSO95455 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGDSO95455 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGDSO95455 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGDSO95455 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGDSO95455 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TGDSO95455 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGDSO95455 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGDSO95455 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGDSO95455 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGDSO95455 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGDSO95455 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGDSO95455 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGDSO95455 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGDSO95455 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGDSO95455 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGDSO95455 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGDSO95455 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGDSO95455 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGDSO95455 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGDSO95455 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGDSO95455 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGDSO95455 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGDSO95455 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGDSO95455 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGDSO95455 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGDSO95455 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGDSO95455 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGDSO95455 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGDSO95455 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGDSO95455 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGDSO95455 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGDSO95455 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGDSO95455 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGDSO95455 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TGDSO95455 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TGDSO95455 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGDSO95455 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGDSO95455 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGDSO95455 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGDSO95455 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGDSO95455 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGDSO95455 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGDSO95455 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGDSO95455 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGDSO95455 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGDSO95455 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGDSO95455 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TGDSO95455 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGDSO95455 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGDSO95455 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGDSO95455 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGDSO95455 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGDSO95455 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TGDSO95455 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGDSO95455 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TGDSO95455 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGDSO95455 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGDSO95455 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGDSO95455 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGDSO95455 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGDSO95455 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGDSO95455 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms