Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB5O95377 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB5O95377 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB5O95377 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB5O95377 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB5O95377 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB5O95377 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB5O95377 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB5O95377 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB5O95377 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB5O95377 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB5O95377 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB5O95377 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB5O95377 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GJB5O95377 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB5O95377 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB5O95377 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB5O95377 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB5O95377 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GJB5O95377 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB5O95377 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GJB5O95377 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GJB5O95377 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB5O95377 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB5O95377 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB5O95377 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB5O95377 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GJB5O95377 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB5O95377 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB5O95377 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB5O95377 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GJB5O95377 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB5O95377 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB5O95377 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB5O95377 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB5O95377 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB5O95377 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB5O95377 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB5O95377 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GJB5O95377 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB5O95377 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB5O95377 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB5O95377 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GJB5O95377 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB5O95377 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB5O95377 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB5O95377 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB5O95377 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB5O95377 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB5O95377 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB5O95377 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GJB5O95377 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB5O95377 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB5O95377 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB5O95377 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB5O95377 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB5O95377 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB5O95377 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GJB5O95377 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB5O95377 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB5O95377 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB5O95377 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB5O95377 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB5O95377 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GJB5O95377 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB5O95377 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB5O95377 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB5O95377 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB5O95377 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB5O95377 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB5O95377 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GJB5O95377 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB5O95377 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB5O95377 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB5O95377 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB5O95377 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB5O95377 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB5O95377 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB5O95377 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB5O95377 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GJB5O95377 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB5O95377 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB5O95377 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB5O95377 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB5O95377 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB5O95377 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB5O95377 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB5O95377 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB5O95377 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB5O95377 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB5O95377 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB5O95377 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJB5O95377 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJB5O95377 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GJB5O95377 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB5O95377 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB5O95377 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB5O95377 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB5O95377 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB5O95377 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms