Protein–RNA interactions for Protein: O95096

NKX2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-2O95096 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NKX2-2O95096 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NKX2-2O95096 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NKX2-2O95096 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms