Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC31AO94979 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC31AO94979 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC31AO94979 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms