Protein–RNA interactions for Protein: O76070

SNCG, Gamma-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCGO76070 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCGO76070 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCGO76070 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCGO76070 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCGO76070 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCGO76070 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCGO76070 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCGO76070 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCGO76070 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCGO76070 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCGO76070 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCGO76070 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNCGO76070 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCGO76070 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCGO76070 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCGO76070 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCGO76070 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCGO76070 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCGO76070 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCGO76070 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNCGO76070 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCGO76070 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCGO76070 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCGO76070 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCGO76070 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCGO76070 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNCGO76070 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCGO76070 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCGO76070 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCGO76070 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCGO76070 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCGO76070 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCGO76070 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCGO76070 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCGO76070 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCGO76070 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCGO76070 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCGO76070 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNCGO76070 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCGO76070 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCGO76070 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCGO76070 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCGO76070 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCGO76070 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNCGO76070 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCGO76070 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCGO76070 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCGO76070 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCGO76070 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNCGO76070 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNCGO76070 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNCGO76070 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNCGO76070 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCGO76070 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCGO76070 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCGO76070 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCGO76070 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCGO76070 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCGO76070 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCGO76070 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCGO76070 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCGO76070 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCGO76070 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SNCGO76070 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCGO76070 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCGO76070 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCGO76070 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCGO76070 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCGO76070 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCGO76070 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCGO76070 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCGO76070 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCGO76070 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNCGO76070 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCGO76070 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCGO76070 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCGO76070 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCGO76070 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCGO76070 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCGO76070 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCGO76070 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCGO76070 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNCGO76070 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNCGO76070 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCGO76070 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms